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Gene id | 1366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Summary SNPs Protein Summary Gene ontology KEGG pathways Diseases PubMed references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Summary |
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Gene Symbol | CLDN7 Gene UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aliases | CEPTRL2, CLDN-7, CPETRL2, Hs.84359, claudin-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene name | claudin 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternate names | claudin-7, clostridium perfringens enterotoxin receptor-like 2, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene location |
17p13.1 (7263192: 7259902) Exons: 5 NC_000017.11 |
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Gene summary(Entrez) |
This gene encodes a member of the claudin family. Claudins are integral membrane proteins and components of tight junction strands. Tight junction strands serve as a physical barrier to prevent solutes and water from passing freely through the paracellular space between epithelial or endothelial cell sheets, and also play critical roles in maintaining cell polarity and signal transductions. Differential expression of this gene has been observed in different types of malignancies, including breast cancer, ovarian cancer, hepatocellular carcinomas, urinary tumors, prostate cancer, lung cancer, head and neck cancers, thyroid carcinomas, etc.. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found.[provided by RefSeq, May 2010] |
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OMIM | 609131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs |
rs222857 Strand: + Allele origin: unknown Allele change: A/C/G/T Mutation type: snp NC_000017.10 g.7164563C>A NC_000017.10 g.7164563C>G NC_000017.10 g.7164563C>T NC_000017.11 g.7261244C>A NC_000017.11 g.7261244C>G NC_000017.11 g.7261244C>T NM_001185022.1 c.224-259G>A NM_001185022.1 c.224-259G>C NM_001185022.1 c.224-259G>T NM_001185023.1 |
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Protein Summary |
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Protein general information | O95471 Name: Claudin 7 (CLDN 7) Length: 211 Mass: 22,418 Tissue specificity: Expressed in kidney, lung and prostate. Isoform 1 seems to be predominant, except in some normal prostate samples, where isoform 2 is the major form. Down-regulated in breast cancers, including ductal carcinoma in situ (DCIS), lobular | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
MANSGLQLLGFSMALLGWVGLVACTAIPQWQMSSYAGDNIITAQAMYKGLWMDCVTQSTGMMSCKMYDSVLALSA ALQATRALMVVSLVLGFLAMFVATMGMKCTRCGGDDKVKKARIAMGGGIIFIVAGLAALVACSWYGHQIVTDFYN PLIPTNIKYEFGPAIFIGWAGSALVILGGALLSCSCPGNESKAGYRVPRSYPKSNSSKEYV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural information |
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Other Databases | GeneCards: CLDN7;  Malacards: CLDN7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene ontology |
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KEGG pathways
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hsa04514 Cell adhesion molecules hsa05160 Hepatitis C hsa04670 Leukocyte transendothelial migration hsa04530 Tight junction | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Diseases
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PubMed references |
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