Search Result
Gene id | 52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene Summary SNPs Protein Summary Gene ontology KEGG pathways Diseases PubMed references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Summary |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ACP1 Gene UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aliases | HAAP, LMW-PTP, LMWPTP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene name | acid phosphatase 1, soluble | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternate names | low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, LMW-PTPase, acid phosphatase of erythrocyte, adipocyte acid phosphatase, cytoplasmic phosphotyrosyl protein phosphatase, low molecular weight cytosolic acid phosphatase, protein tyrosine phosphatase, red , | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene location |
2p25.3 (264868: 278282) Exons: 7 NC_000002.12 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene summary(Entrez) |
The product of this gene belongs to the phosphotyrosine protein phosphatase family of proteins. It functions as an acid phosphatase and a protein tyrosine phosphatase by hydrolyzing protein tyrosine phosphate to protein tyrosine and orthophosphate. This enzyme also hydrolyzes orthophosphoric monoesters to alcohol and orthophosphate. This gene is genetically polymorphic, and three common alleles segregating at the corresponding locus give rise to six phenotypes. Each allele appears to encode at least two electrophoretically different isozymes, Bf and Bs, which are produced in allele-specific ratios. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 171500 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs |
rs1801133
Strand: Allele origin: T(germline)/C(germline) Allele change: C/T Mutation type: snp CM000663.2 g.11796321G>A NC_000001.10 g.11856378G>A NC_000001.11 g.11796321G>A NG_013351.1 g.14783C>T NM_001330358.1 c.788C>T NM_005957.4 c.665C>T NP_001317287.1 p.Ala263Val NP_005948.3 p.Ala222Val XP_005263515.1 p.Ala263Val XP_005263516.1 p.Ala245Val XP_005263517.1 p.Ala222Val XP_005263518.1 p.Ala222Val XP_005263519.1 p.Ala222Val XP_005263520.1 p.Ala140Val XP_011539797.1 p.Ala262Val XP_011539798.1 p.Ala263Val XP_016856817.1 p.Ala263Val Clinical Significance: drug-response drug-response drug-response rs1042839 Strand: Allele origin: Allele change: C/T Mutation type: snp CM000673.2 g.101051471G>A NC_000011.10 g.101051471G>A NC_000011.9 g.100922202G>A NG_016475.1 g.83343C>T NM_000926.4 c.2310C>T NM_001202474.3 c.1818C>T NM_001271161.2 c.1512C>T NM_001271162.1 c.528C>T NP_000917.3 p.His770= NP_001189403.1 p.His606= NP_001258090.1 p.His504= NP_001258091.1 p.His176= NR_073141.2 n.2303C>T NR_073142.2 n.2186C>T NR_073143.2 n.1997C>T XP_006718921.1 p.His770= rs11264799 Strand: Allele origin: Allele change: C/T Mutation type: snp CM000663.2 g.157700967C>T NC_000001.10 g.157670757C>T NC_000001.11 g.157700967C>T NG_023241.1 g.4891G>A NM_001320333.1 c.-402G>A NM_052939.3 c.-402G>A NR_135214.1 n.-95G>A NR_135215.1 n.-95G>A NR_135216.1 n.-95G>A NR_135217.1 n.-95G>A XR_241064.1 n.-204G>A XR_241065.1 n.-204G>A XR_241066.1 n.-204G>A rs17561 Strand: - Allele origin: unknown Allele change: G/T Mutation type: snp NC_000002.12 g.112779646C>A NC_000002.11 g.113537223C>A NG_008850.1 g.10749G>T NM_000575.4 c.340G>T NP_000566.3 p.Ala114Ser rs945635 Strand: + Allele origin: unknown Allele change: A/C/G Mutation type: snp XM_006711145.1 c.-11G>C XM_006711145.1 c.-11G>T NM_001320333.1 c.-11G>C NM_001320333.1 c.-11G>T XM_005244872.1 c.-11G>C XM_005244872.1 c.-11G>T XM_005244870.1 c.-11G>C XM_005244870.1 c.-11G>T XM_005244871.1 c.-11G>C XM_005244871.1 c.-11G>T NR_135214.1 n. rs1304037 Strand: - Allele origin: unknown Allele change: A/G Mutation type: snp NC_000002.11 g.113532236T>C NC_000002.12 g.112774659T>C NG_008850.1 g.15736A>G NM_000575.4 c.*408A>G rs2107538 Strand: Allele origin: Allele change: C/T Mutation type: snp CM000679.2 g.35880776C>T NC_000017.10 g.34207780C>T NC_000017.11 g.35880776C>T NG_015990.1 g.4598G>A NM_001278736.1 c.-471G>A NM_002985.2 c.-471G>A NT_187614.1 g.115308C>T NW_004166864.2 g.172944C>T XR_001752852.1 n.426+702C>T XR_001756367.1 n.426+702C>T XR_934696.2 n.91-3606C>T XR_934697.2 n.91-3606C>T XR_951963.2 n.91-3606C>T XR_951964.2 n.91-3606C>T rs1801133 Strand: - Allele origin: germline,germline Allele change: C/T Mutation type: snp NC_000001.11 g.11796321G>A NC_000001.10 g.11856378G>A NG_013351.1 g.14783C>T NM_001330358.1 c.788C>T NM_005957.4 c.665C>T NP_001317287.1 p.Ala263Val NP_005948.3 p.Ala222Val XM_005263462.1 c.665C>T XM_005263462.4 c.665C>T XM_005263460.4 c.665C>T XM_005263 Clinical Significance: drug-response rs2280788 Strand: Allele origin: Allele change: C/G Mutation type: snp CM000679.2 g.35880401G>C NC_000017.10 g.34207405G>C NC_000017.11 g.35880401G>C NG_015990.1 g.4973C>G NM_001278736.1 c.-96C>G NM_002985.2 c.-96C>G NT_187614.1 g.114933G>C NW_004166864.2 g.172569G>C XR_001752852.1 n.426+327G>C XR_001756367.1 n.426+327G>C XR_934696.2 n.91-3981G>C XR_934697.2 n.91-3981G>C XR_951963.2 n.91-3981G>C XR_951964.2 n.91-3981G>C rs2294021 Strand: Allele origin: Allele change: A/C/T Mutation type: snp CM000685.2 g.49249149T>A CM000685.2 g.49249149T>C NC_000023.10 g.49105610T>C NC_000023.11 g.49249149T>A NC_000023.11 g.49249149T>C NG_007392.1 g.20679A>G NG_007392.1 g.20679A>T NG_021311.2 g.18685T>A NG_021311.2 g.18685T>C NM_014008.4 c.1540-18T>A NM_014008.4 c.1540-18T>C NW_004070880.2 g.1488578T>C XR_430506.2 n.1638-18T>A XR_430506.2 n.1638-18T>C Clinical Significance: Benign rs2856836 Strand: - Allele origin: unknown Allele change: C/T Mutation type: snp NC_000002.11 g.113532083A>G NC_000002.12 g.112774506A>G NG_008850.1 g.15889T>C NM_000575.4 c.*561T>C rs3761959 Strand: - Allele origin: unknown Allele change: A/G Mutation type: snp NC_000001.10 g.157669278C>T NC_000001.11 g.157699488C>T NG_023241.1 g.6370G>A NM_001320333.1 c.52+204G>A NM_052939.3 c.52+204G>A NR_135217.1 n.359+204G>A NR_135216.1 n.359+204G>A NR_135215.1 n.359+204G>A NR_135214.1 n.359+204G>A XM_005244872.1 c.52+204G> rs3783525 Strand: - Allele origin: unknown Allele change: A/T Mutation type: snp NC_000002.12 g.112784242T>A NC_000002.11 g.113541819T>A NG_008850.1 g.6153A>T NM_000575.4 c.-9+201A>T rs3783550 Strand: - Allele origin: unknown Allele change: A/C Mutation type: snp NC_000002.11 g.113532885G>T NC_000002.12 g.112775308G>T NG_008850.1 g.15087C>A NM_000575.4 c.616-41C>A rs3783553 Strand: - Allele origin: unknown Allele change: -/TTCA Mutation type: in-del NC_000002.12 g.112774138_112774139insTGAA NC_000002.11 g.113531715_113531716insTGAA NG_008850.1 g.16256_16257insTTCA NM_000575.4 c.*928_*929insTTCA rs7528684 Strand: + Allele origin: unknown Allele change: A/G Mutation type: snp NC_000001.10 g.157670816A>G NC_000001.11 g.157701026A>G NG_023241.1 g.4832T>C NM_001320333.1 c.-461T>C NM_052939.3 c.-461T>C NR_135216.1 n.-154T>C NR_135215.1 n.-154T>C NR_135217.1 n.-154T>C NR_135214.1 n.-154T>C XM_005244871.1 c.-263T>C XM_005244872.1 c rs500760 Strand: Allele origin: Allele change: A/G Mutation type: snp CM000673.2 g.101039260T>C NC_000011.10 g.101039260T>C NC_000011.9 g.100909991T>C NG_016475.1 g.95554A>G NM_000926.4 c.2658A>G NM_001202474.3 c.2166A>G NM_001271161.2 c.1860A>G NM_001271162.1 c.876A>G NP_000917.3 p.Gln886= NP_001189403.1 p.Gln722= NP_001258090.1 p.Gln620= NP_001258091.1 p.Gln292= NR_073141.2 n.2599A>G NR_073142.2 n.2482A>G NR_073143.2 n.2214A>G rs10895068 Strand: - Allele origin: unknown Allele change: A/G Mutation type: snp NC_000011.9 g.101000214C>T NC_000011.10 g.101129483C>T NM_001271161.2 c.-905G>A NM_001271162.1 c.-201G>A NG_016475.1 g.5331G>A NM_000926.4 c.-413G>A NM_001202474.3 c.-905G>A NR_073141.2 n.-420G>A NR_073142.2 n.-420G>A NR_073143.2 n.-420G>A NR_073144.1 n.4 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Summary |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein general information | P24666 Name: Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase (LMW PTP) (LMW PTPase) (EC 3.1.3.48) (Adipocyte acid phosphatase) (Low molecular weight cytosolic acid phosphatase) (EC 3.1.3.2) (Red cell acid phosphatase 1) Length: 158 Mass: 18,042 Tissue specificity: T-lymphocytes express only isoform 2. {ECO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
MAEQATKSVLFVCLGNICRSPIAEAVFRKLVTDQNISENWRVDSAATSGYEIGNPPDYRGQSCMKRHGIPMSHVA RQITKEDFATFDYILCMDESNLRDLNRKSNQVKTCKAKIELLGSYDPQKQLIIEDPYYGNDSDFETVYQQCVRCC RAFLEKAH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural information |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Databases | GeneCards: ACP1;  Malacards: ACP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene ontology |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG pathways
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa01100 Metabolic pathways hsa04520 Adherens junction hsa00730 Thiamine metabolism hsa00740 Riboflavin metabolism | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Diseases
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubMed references |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|