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Gene id | 80312 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Summary Protein Summary Gene ontology KEGG pathways Diseases PubMed references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Summary |
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Gene Symbol | TET1 Gene UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aliases | CXXC6, LCX, bA119F7.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene name | tet methylcytosine dioxygenase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternate names | methylcytosine dioxygenase TET1, CXXC finger 6, CXXC zinc finger 6, CXXC-type zinc finger protein 6, TET1 splice variant VP_DE4, TET1 splice variant VP_DE456, leukemia-associated protein with a CXXC domain, ten-eleven translocation 1 gene protein, ten-eleven translocation-1, tet oncogene 1, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene location |
10q21.3 (105145874: 105279802) Exons: 12 NC_000004.12 |
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Gene summary(Entrez) |
DNA methylation is an epigenetic mechanism that is important for controlling gene expression. The protein encoded by this gene is a demethylase that belongs to the TET (ten-eleven translocation) family. Members of the TET protein family play a role in the DNA methylation process and gene activation. [provided by RefSeq, Sep 2015] |
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OMIM | 607790 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Summary |
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Protein general information | Q8NFU7 Name: Methylcytosine dioxygenase TET1 (EC 1.14.11.n2) (CXXC-type zinc finger protein 6) (Leukemia-associated protein with a CXXC domain) (Ten-eleven translocation 1 gene protein) Length: 2136 Mass: 235,309 Tissue specificity: Expressed in fetal heart, lung and brain, and in adult skeletal muscle, thymus and ovary. Not detected in adult heart, lung or brain. Up-regulated in glioblastoma cells (at protein level) (PubMed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
MSRSRHARPSRLVRKEDVNKKKKNSQLRKTTKGANKNVASVKTLSPGKLKQLIQERDVKKKTEPKPPVPVRSLLT RAGAARMNLDRTEVLFQNPESLTCNGFTMALRSTSLSRRLSQPPLVVAKSKKVPLSKGLEKQHDCDYKILPALGV KHSENDSVPMQDTQVLPDIETLIGVQNPSLLKGKSQETTQFWSQRVEDSKINIPTHSGPAAEILPGPLEGTRCGE GLFSEETLNDTSGSPKMFAQDTVCAPFPQRATPKVTSQGNPSIQLEELGSRVESLKLSDSYLDPIKSEHDCYPTS SLNKVIPDLNLRNCLALGGSTSPTSVIKFLLAGSKQATLGAKPDHQEAFEATANQQEVSDTTSFLGQAFGAIPHQ WELPGADPVHGEALGETPDLPEIPGAIPVQGEVFGTILDQQETLGMSGSVVPDLPVFLPVPPNPIATFNAPSKWP EPQSTVSYGLAVQGAIQILPLGSGHTPQSSSNSEKNSLPPVMAISNVENEKQVHISFLPANTQGFPLAPERGLFH ASLGIAQLSQAGPSKSDRGSSQVSVTSTVHVVNTTVVTMPVPMVSTSSSSYTTLLPTLEKKKRKRCGVCEPCQQK TNCGECTYCKNRKNSHQICKKRKCEELKKKPSVVVPLEVIKENKRPQREKKPKVLKADFDNKPVNGPKSESMDYS RCGHGEEQKLELNPHTVENVTKNEDSMTGIEVEKWTQNKKSQLTDHVKGDFSANVPEAEKSKNSEVDKKRTKSPK LFVQTVRNGIKHVHCLPAETNVSFKKFNIEEFGKTLENNSYKFLKDTANHKNAMSSVATDMSCDHLKGRSNVLVF QQPGFNCSSIPHSSHSIINHHASIHNEGDQPKTPENIPSKEPKDGSPVQPSLLSLMKDRRLTLEQVVAIEALTQL SEAPSENSSPSKSEKDEESEQRTASLLNSCKAILYTVRKDLQDPNLQGEPPKLNHCPSLEKQSSCNTVVFNGQTT TLSNSHINSATNQASTKSHEYSKVTNSLSLFIPKSNSSKIDTNKSIAQGIITLDNCSNDLHQLPPRNNEVEYCNQ LLDSSKKLDSDDLSCQDATHTQIEEDVATQLTQLASIIKINYIKPEDKKVESTPTSLVTCNVQQKYNQEKGTIQQ KPPSSVHNNHGSSLTKQKNPTQKKTKSTPSRDRRKKKPTVVSYQENDRQKWEKLSYMYGTICDIWIASKFQNFGQ FCPHDFPTVFGKISSSTKIWKPLAQTRSIMQPKTVFPPLTQIKLQRYPESAEEKVKVEPLDSLSLFHLKTESNGK AFTDKAYNSQVQLTVNANQKAHPLTQPSSPPNQCANVMAGDDQIRFQQVVKEQLMHQRLPTLPGISHETPLPESA LTLRNVNVVCSGGITVVSTKSEEEVCSSSFGTSEFSTVDSAQKNFNDYAMNFFTNPTKNLVSITKDSELPTCSCL DRVIQKDKGPYYTHLGAGPSVAAVREIMENRYGQKGNAIRIEIVVYTGKEGKSSHGCPIAKWVLRRSSDEEKVLC LVRQRTGHHCPTAVMVVLIMVWDGIPLPMADRLYTELTENLKSYNGHPTDRRCTLNENRTCTCQGIDPETCGASF SFGCSWSMYFNGCKFGRSPSPRRFRIDPSSPLHEKNLEDNLQSLATRLAPIYKQYAPVAYQNQVEYENVARECRL GSKEGRPFSGVTACLDFCAHPHRDIHNMNNGSTVVCTLTREDNRSLGVIPQDEQLHVLPLYKLSDTDEFGSKEGM EAKIKSGAIEVLAPRRKKRTCFTQPVPRSGKKRAAMMTEVLAHKIRAVEKKPIPRIKRKNNSTTTNNSKPSSLPT LGSNTETVQPEVKSETEPHFILKSSDNTKTYSLMPSAPHPVKEASPGFSWSPKTASATPAPLKNDATASCGFSER SSTPHCTMPSGRLSGANAAAADGPGISQLGEVAPLPTLSAPVMEPLINSEPSTGVTEPLTPHQPNHQPSFLTSPQ DLASSPMEEDEQHSEADEPPSDEPLSDDPLSPAEEKLPHIDEYWSDSEHIFLDANIGGVAIAPAHGSVLIECARR ELHATTPVEHPNRNHPTRLSLVFYQHKNLNKPQHGFELNKIKFEAKEAKNKKMKASEQKDQAANEGPEQSSEVNE LNQIPSHKALTLTHDNVVTVSPYALTHVAGPYNHWV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural information |
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Other Databases | GeneCards: TET1;  Malacards: TET1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene ontology |
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Diseases
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PubMed references |
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